Geboren 1702 in Como, Italien. In Spanien, wo er vor dem Krieg in Österreich ankommt, erhält er weitreichende Befugnisse, um in den Royal Cajas von Mexiko die Rente der Nachkommen von Moctezuma zu sammeln.
Er reiste 1736 nach Neuspanien. Während der acht Jahre seines Aufenthalts widmete er sich der Untersuchung der Erscheinungen der Jungfrau von Guadalupe und sammelte beträchtliches grafisches und piktografisches Material. Es fördert die Krönung des Guadalupan-Images, was Misstrauen gegenüber den vizeköniglichen Behörden hervorruft. Er wird gefangen genommen und seine Sammlung wird gestrippt. Monate später, nach seiner Deportation nach Spanien, begibt er sich auf ein Schiff, das in die Hände der Piraten fällt, die ihn in Gibraltar verlassen.
Mit großartigen Werken kam er nach Spanien und nahm Kontakt mit dem Sammler Mariano Fernández de Echeverríay Veytia auf, der seinen Freispruch als Royal Chronicler of the Indies erhielt, eine Position, die Boturini ablehnte, sich dem Schreiben über die Geschichte der indigenen Völker zu widmen. Obwohl er seine Sammlung nie wiedererlangt, schrieb er den Katalog des Indischen Museums darüber. Seine Arbeit ist sehr originell und gut dokumentiert. Er starb in Madrid an einem ungewissen Datum zwischen 1750 und 1755.
