Calleja war der Organisator und Chef der Zentralarmee (1810-12) während des Unabhängigkeitskrieges und der sechzigste Vizekönig von Neuspanien, der von 1813 bis 1816 regierte und einer der großen Bösewichte in der Geschichte Mexikos war.
Er wurde in Medina del Campo, Valladolid, geboren und starb in Valencia. Er machte seinen ersten Feldzug als Leutnant in der unglückseligen Algier-Expedition, angeführt von Graf O'Reilly unter Karl III. Er war Lehrer und Kapitän einer Kompanie von 100 Kadetten, darunter Joaquín Blacke, Regent nach Spanien, und Francisco Javier de Elío, zukünftiger Vizekönig von Buenos Aires, an der Militärschule von Puerto de Santa María.
Er kam mit dem zweiten Grafen von Revillagigedo (1789) als Kapitän des festen Infanterieregiments von Puebla nach Neuspanien und führte mehrere Kommissionen erfolgreich aus, bis er zum Kommandeur der Brigade San Luis Potosí ernannt wurde. Dort hatte er den Truppenkanton unter seinem Kommando, den Vizekönig Marquina versammeln sollte, der mit seiner Kompanie von Kapitän Ignacio Allende begleitet wurde. Dort heiratete er auch Doña Francisca de la Gándara, Tochter der königlichen Fahne dieser Stadt, die Eigentümerin der großen Hacienda de Bledos war; und er erlangte großen Einfluss auf die Menschen des Landes, die ihn als "den Meister Don Félix" kannten.
Als der Aufstand von Hidalgo stattfand, ohne auf Befehle des Vizekönigs zu warten, setzte er die Truppen seiner Brigade in Waffen, erhöhte sie mit neuen und organisierte und disziplinierte sie. Er bildete die kleine (4.000 Mann), aber mächtige Armee des Zentrums, die es schaffte, zu besiegen Hidalgo und stellen Sie sich der gewaltigen Offensive von Morelos.
Calleja zog sich nach der Belagerung von Cuautla (Mai 1812) nach Mexiko zurück, er hatte in seiner Residenz (Casa de Moncada, später Iturbide Palace genannt) seinen kleinen Hof, wo die Unzufriedenheit mit der Regierung von Venegas, der Geldmangel vorgeworfen wurde und machtlos, die Revolution einzudämmen und zu beenden. Ungefähr 4 Jahre später regierte er das Land als Vizekönig. Er vervollständigte die Armee und erreichte 40.000 Mann Linientruppen und Provinzmilizen sowie ebenso viele Royalisten, die in allen Städten und Haciendas organisiert waren. Beide kamen größtenteils aus den revolutionären Provinzen selbst. er organisierte die Staatskasse neu, deren Produkte mit neuen Steuern zunahmen; es stellte den Handelsverkehr mit den häufigen Konvois wieder her, die wieder von einem Ende des Königreichs zum anderen zirkulierten, und dem regulären Postdienst; und erhöhte die Leistung und Zollprodukte.
Dies setzt die kontinuierlichen und intensiven Kampagnen voraus, die er gegen die Aufständischen förderte, in denen Morelos erlag. Als entschlossener und skrupelloser Mann hielt er sich nicht in den Medien auf und schloss die Augen vor den Missbräuchen, die seine Kommandeure begangen hatten, wenn sie der wahren Sache mit Eifer dienten. So wurde er seinen Zeitgenossen gegenüber hasserfüllt.
Nach seiner Rückkehr nach Spanien erhielt er den Titel des Grafen von Calderón (1818) und die großen Kreuze von Isabel la Católica und San Hermenegildo. Nachdem er Generalkapitän von Andalusien und Gouverneur von Cádiz war, hatte er das Kommando über die Expeditionstruppen Südamerikas, die sich vor seiner Abreise erhoben und ihn ins Gefängnis brachten (1820). Als er freigelassen wurde, lehnte er die Regierung von Valencia ab und war bis 1823 erneut auf Mallorca inhaftiert. 1825 "gereinigt", blieb er bis zu seinem Tod in der Kaserne in Valencia.
