Mit nur drei oder vier Monaten Regen pro Jahr konnte Colima dank der vielen Ströme aus den höheren Teilen des Volcán de Fuego die notwendigen Bedingungen für das menschliche Leben erfüllen. Es gibt Hinweise darauf, dass sich der Mensch um 1.500 v. Chr. In diesem Tal niedergelassen hat.
Die als Complejo Capacha bekannte Kultur bestand aus landwirtschaftlichen und sesshaften Gesellschaften, aus denen die berühmte Tradition der Schachtgräber hervorging: Leichenkammern, in denen reichhaltige Opfergaben deponiert wurden und die über einen vertikalen und runden Schacht von 1,20 bis 1,40 zugänglich waren m im Durchmesser. Im Erholungszentrum Tampumachay in der Stadt Los Ortices befinden sich drei Gräber mit dem ursprünglichen Schacht und den Gewölben sowie eine Reihe von Steingefäßen und Werkzeugen, die den Toten angeboten werden.
Als die Religion ab 600 n. Chr. Ein größeres Gewicht in der sozialen Organisation hatte, wurden Zeremonienräume aus Plätzen, abgegrenzten Innenhöfen und rechteckigen Plattformen von beträchtlichen Dimensionen errichtet. Die architektonisch komplexeren Siedlungen entwickelten sich erst nach 900 n. Chr.
Der Ort, der diese Bühne am besten repräsentiert, ist La Campana. Es ist eine große Siedlung - ihre Zeremonienfläche betrug mehr als 50 Hektar - mit einer Reihe rechteckiger Plattformen. An der Spitze dieser Plattformen befinden sich Bereiche, die wahrscheinlich mit der Lagerung von Getreide zusammenhängen. Es gibt auch komplexe Wohnsysteme, die zweifellos von zivilen und religiösen Führern besetzt worden sein müssen.
An dieser Stelle fallen zwei Aspekte auf: die Lage von Schachtgräbern, die in zeremonielle Räume integriert sind, und das Vorhandensein eines komplexen Netzes von Entwässerungs- und Wasserleitungen.
Eine weitere wichtige archäologische Stätte in Colima ist El Chanal, etwa 6 km nördlich der Stadt gelegen, die eine maximale Ausdehnung von 200 Hektar haben muss. Da es sich auf beide Ufer des Colima erstreckt, ist es als El Chanal Este und El Chanal Oeste bekannt. Letzteres zeigt, obwohl es nicht vollständig untersucht wurde, eine offensichtliche Komplexität, da es Innenhöfe, Plätze, Strukturen, Kanäle und Straßen hat. El Chanal Este hingegen wurde weitgehend zerstört, weil die moderne Stadt, die ihren Namen trägt, auf ihren Ruinen errichtet wurde.
Die Untersuchungen zeigen, dass an dieser Stelle indikative Elemente des Doppeltempels, das Konzept des Bankaltars und der Altarplattformen mit kleinen Abmessungen sowie eine große Anzahl von Massenskulpturen, Gravuren und Steinreliefs vorhanden sind; Zahlen zu den Xantiles; polychrome Keramik, die Umrisse von Adlern und gefiederten Schlangen bildet; und schließlich Metall. Das herausragendste an dieser Kultur ist jedoch das Vorhandensein des städtischen Phänomens und die Existenz des Kalenders.
